Klomifen jest od dawna zaufanym lekiem doustnym, na którym opiera się jego bezpieczeństwo, skuteczność i stosunkowo niski koszt. Clomiphene stosuje się w leczeniu braku lub nieregularnych cykli menstruacyjnych (indukcja owulacji), w celu leczenia stanu zwanego defektem fazy lutealnej poprzez zwiększenie wydzielania progesteronu w drugiej połowie cyklu oraz w celu zwiększenia przewidywalności długości cykli menstruacyjnych, poprawiając w ten sposób czas stosunku lub sztuczne zapłodnienie. Klomifen można również stosować w celu zwiększenia owulacji u kobiet, które już owulują (zwiększenie owulacji).
Clomid (cytrynian klomifenu BP) jest wskazany w leczeniu niewydolności owulacyjnej u kobiet pragnących zajść w ciążę. Clomid jest wskazany wyłącznie u pacjentek, u których wykazano zaburzenia owulacji. Przed podaniem Clomidu należy wykluczyć inne przyczyny niepłodności lub je odpowiednio leczyć.